一、pcr仪器各个温度的含义?
PCR仪的三种控温模式
在进行PCR仪中控温模式设定时,一般有三个选项:Block、Tube及Probe。下面就这三种模式种简单的介绍:
PCR仪的温度传感器一般是在模块下面的,也就是说仪器实际能够控制的是模块的温度,Block模式指的就是仪器以控制Block的温度为目的,也就是说你输入95度5分钟,则模块的温度达到95度后开始计时,5分钟后完成。这是zui基本的控温模式。
但是,实际上我们输入95度5分钟是希望PCR管内的温度达到95后开始计时5分钟。PCR仪器开发人员可以先将模块温度控制到97度(比如而已,如果不超过95度,管内温度可以很长时间才能达到95度或根本达不到),过几秒钟后,等到管内温度达到95度,再将模块温度降到95度。这样做既达到了管内温度到95度,且速度较快。但过冲的温度量与时间及PCR管的导热系数、PCR反应液的体积都有关系。这就是各个PCR仪厂家的核心技术了。这种控温方式就称为Tube模式。
如果直接将一个温度传感器加入PCR管中,直接测量PCR管内的温度不是也可以吗?这就是Probe模式,也就是在一个不进行PCR反应的管内放入一个温度探头,仪器根据温度探头测到的温度来控制PCR管内的温度。但传感器的数据检测、分析及反馈是需要时间的,这种控制模式不一定比Tube模式好,而且如果反应体积发生变化时,就比较麻烦了。
因此,如今的PCR仪就都是Block和Tube两种模式了。如果是正常的PCR反应,一般选Tube模式。如果是长时间保温且对温度过冲要求很高,则可以考虑用Block模式。
二、pcr仪盖子的温度如何设置?
现在pcr仪一般都是热盖pcr仪。热盖的作用是无需加石蜡即可启动pcr反应,其原理是通过加热热盖使pcr tube的盖子达到恒定高温,从而防止pcr过程中反复加热和降温导致tube中的水蒸气冷凝,而导致反应体系中的的水分挥发蒸干,破坏反应体系,影响扩增结果。同时,避免了加入石蜡对pcr后期纯化处理的麻烦。
根据热盖的作用,不难看出热盖的温度略高于水的沸点即可,常规温度设置为105~110度。
三、pcr温度梯度设置?
温度梯度pcr一般主要是指退火温度梯度。如果PCR仪支持的话,一次可以做好几个温度梯度,象AIB的可以做六个,而有些公司的是模仿梯度,比如一边高一边低,这样梯度温度可能误差大一点。如果仪器不支持,可能就麻烦了,想做六个温度就得做六次PCR了。每一次设成不同的温度。
四、pcr仪设置温度原理?
在pcr反应过程中,要使用三个不同的温度变化,有变性,退火,扩增三个不同的反应阶段,而这三个反应需要的最适温度不同。具体设置如下:
1、变性反应温度的设置
当温度控制在90 °C以上时DNA会发生变性,双链DNA解链成单链。
2、退火反应温度的设置
当温度下降到50 °C的时候,DNA复性,两种引物通过碱基互补配对与两条单链DNA结合。
3、扩增反应温度的设置
当温度上升到72 °C左右时延伸,DNA 聚合酶在此时有最大活性,能够催化4 种脱氧核苷酸合成新的DNA链。
五、pcr仪怎么设置温度降落?
一般退火温度为从Tm+5度降落至Tm-10度,每度2个cycle,最后在tm-10度上增加5-10个cycle.例:Tm为58度,则从63度降落到48度,每度2个cycles,最后在48度加5-10个cycles。如果效果不好,可以再微调。
六、pcr延伸温度如何确定?
延伸需要复性,下降到50℃左右。
七、PCR实验温度如何设计?
室内设计温度
1)、温度控制:根据细胞的适宜生长温度,温度控制在 25℃以下,考虑温度的浮动范围,保证温度在 23℃左右,为满足温度要求,具体措施:采用组合式空调机组,对室内进行补新风通风,空调器的冷热源采用循环式温控系统,冬季适当减少排风量,以减小能耗,同时送风直接到工作人员区域,保证工作人员的舒适的工作环境。
2) 湿度控制:根据对湿度条件的依赖特点,控制湿度在 30%~70℃ 左右。
3) 杀菌措施:在室内设置紫外杀菌灯对可能存在的菌种进行灭活处理。
八、pcr延伸温度如何计算?
引物延伸一般在72℃进行(Taq酶最适温度)。但在扩增长度较短且退火温度较高时,本步骤可省略延伸时间随扩增片段长短而定,一般推荐在1000bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生设定为1min/kbp。
PCR的过程:
1、DNA变性:(90℃-96℃):双链DNA模板在热作用下,氢键断裂,形成单链DNA
2、退火:(60℃-65℃):系统温度降低,引物与DNA模板结合,形成局部双链。
3、延伸:(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性最佳)的作用下,以dNTP为原料,从引物的3′端开始以从5′→3′端的方向延伸,合成与模板互补的DNA链。
九、pcr退火温度如何确定?
退火温度=4×(G+C)+2×(A+T)-(5~8) 只是粗算,有时不灵,但比较简便。
用primer5(or oligo6)计算,引物配对好后,primer5可以显示Tm,我认为这个值就是退火温度,我的经验再加2 or 3度最好。
十、PCR仪如何设置?
1、按 PCR 仪正面左下角电源开关,启动 PCR 仪。
2、放 PCR 离心管,先把顶盖向上扳,再往前推,露出放样孔,PCR 管
放入前应加好反应体系各组分,再放入 PCR 离心管。
3、反向重复第二步骤将顶盖板向后拉,盖好顶盖。
4、按 F2“Create”新建一个扩增的 PCR 程序。
5、按控制台面右方上下左右方向键,可随意移动编辑位置,输入需要
的温度、时间、循环数等。
6、据 PCR 离心管中加入的反应体积总量,在“Reaction volume”后输入
相应数值,有 Std“1~100ul”和 9600“1~50ul”两档可供选择。
7、按 F1“Start”启动
8、按“INFO”对应键查看 PCR 结束键。
9、扩增完成后按台面左方“Stop”键退出。
10、按“Hist”,可查看上次扩增的历史记录。11、完全退出后,按台面左下方电源开关,拔出插销,切断电源。