一、PCR扩增退火温度确定?
计算退火温度的方法:
1. 退火温度=4×(G+C)+2×(A+T)-(5~8) 只是粗算,有时不灵,但比较简便。
2.用primer5(or oligo6)计算,引物配对好后,primer5可以显示Tm,我认为这个值就是退火温度,我的经验再加2 or 3度最好。
3.合成引物的单子上也有个Tm,减去5~8也可,但有些公司提供的Tm就是方法1计算的。
二、pcr扩增计算?
两个都是通过标准曲线法计算扩增效率,其实是一样的,按照定义理解,完全扩增的话1条变2条,2条变4条,扩增效率200%,但一般通过软件计算都是提供第一种方法(用的比较多),扩增效率最大为100%。本质上两者是相同的。
三、PCR基因扩增原理?
PCR(聚合酶链式反应)是一种体外扩增DNA的技术,其基本原理是在一定的条件下,利用DNA聚合酶酶活性,通过反复进行三步循环反应,使目标DNA序列在体外得以扩增。
PCR扩增的三个步骤如下:
反应体系的变性:将PCR反应体系中的DNA双链分离成两条单链,使其成为模板链。
引物的结合:在反应体系中加入两个特异性引物,它们分别与模板链的两端互补结合,形成引物-模板复合物。
DNA聚合酶的扩增:在反应体系中加入DNA聚合酶,它会在引物-模板复合物上开始扩增新的DNA链。DNA聚合酶从引物的3'端开始向5'端移动,沿着模板链合成新的DNA链。这个过程被称为扩增。
通过不断重复这三个步骤,PCR反应可以在短时间内扩增出大量目标DNA序列。PCR技术已经广泛应用于基因克隆、基因检测、疾病诊断、法医学等领域。
四、pcr扩增技术原理?
PCR技术的基本原理 类似于DNA的 天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。
PCR是一种体外DNA 扩增技术,是在模板DNA、引物和4种脱氧核苷酸存在的条件下,依赖于DNA聚合酶的酶促合反应,将待扩增的DNA片段与其两侧互补的寡核苷酸链引物经“高温变性——低温退火——引物
PCR扩增仪
延伸”三步反应的多次循环,使DNA片段在数量上呈指数增加,从而在短时间内获得我们所需的大量的特定基因片段。
在环境检测中,靶核酸序列往往存在于—个复杂的混合物如细胞提取液中,且含量很低,对于探测这种复杂群体中的特异微生物或某个基因,杂交就显得不敏感。使用PCR技术可将靶序列放大几个数量级,再用探针杂交探测对被扩增序列作定性或定量研究分析微生物群体结构。PCR技术常与其他技术结合起来使用, 如RT-PCR、竞争PCR、槽式PCR、RAPf)、ARDRA等。
五、pcr仪器各个温度的含义?
PCR仪的三种控温模式
在进行PCR仪中控温模式设定时,一般有三个选项:Block、Tube及Probe。下面就这三种模式种简单的介绍:
PCR仪的温度传感器一般是在模块下面的,也就是说仪器实际能够控制的是模块的温度,Block模式指的就是仪器以控制Block的温度为目的,也就是说你输入95度5分钟,则模块的温度达到95度后开始计时,5分钟后完成。这是zui基本的控温模式。
但是,实际上我们输入95度5分钟是希望PCR管内的温度达到95后开始计时5分钟。PCR仪器开发人员可以先将模块温度控制到97度(比如而已,如果不超过95度,管内温度可以很长时间才能达到95度或根本达不到),过几秒钟后,等到管内温度达到95度,再将模块温度降到95度。这样做既达到了管内温度到95度,且速度较快。但过冲的温度量与时间及PCR管的导热系数、PCR反应液的体积都有关系。这就是各个PCR仪厂家的核心技术了。这种控温方式就称为Tube模式。
如果直接将一个温度传感器加入PCR管中,直接测量PCR管内的温度不是也可以吗?这就是Probe模式,也就是在一个不进行PCR反应的管内放入一个温度探头,仪器根据温度探头测到的温度来控制PCR管内的温度。但传感器的数据检测、分析及反馈是需要时间的,这种控制模式不一定比Tube模式好,而且如果反应体积发生变化时,就比较麻烦了。
因此,如今的PCR仪就都是Block和Tube两种模式了。如果是正常的PCR反应,一般选Tube模式。如果是长时间保温且对温度过冲要求很高,则可以考虑用Block模式。
六、pcr扩增技术温度控制的目的是什么?
目的是合成大量DNA片段,属于基因工程操作程序的 目的基因的获取 。
大量扩增目标基因片段,用于基因工程或检测。如:怀疑牛肉中掺杂马肉,就可以用马基因的特异性引物对样品进行PCR,经扩增后如果能够得到响应条带,就可证实。方法简单易行,相比其它方法有优越性。
七、pcr扩增名词解释?
PCR的意思是聚合酶链式反应,能够用来扩增DNA,从而将微量的DNA扩增到能够检测的程度。有些病毒的核酸是DNA,需要采用这个方法进行检测。
所以PCR并不是进行的检查,而是检测DNA的一种方法。比如乙肝病毒DNA定量,用的就是这一种方法。检查DNA的目的,一方面是可以诊断疾病,如果连病原体的DNA都能检测到,就说明感染了这种病原体;
另一方面是判断病毒复制的多少,从而判断病情严重程度或者治疗效果。
八、为什么要用PCR扩增?
PCR三步骤:变性、退火、延伸,变性是高温下DNA双链变成单链,退火是低温下引物跟DNA模板结合,引物不跟模板配对,是没法扩增的
九、pcr扩增体系包括什么?
PCR扩增体系主要由引物,酶,dNTP,模板,Mg2+等基本要素组成。
(一) PCR扩增原理
PCR(Polymerase ChainReaction) , 即聚合酶链反应, 是由Kary Mullis等人首创的一项体外快速扩增DNA的方法, 它可使极微量的某一特定序列的DNA片段在数小时内特异性扩增至百万倍以上。PCR扩增DNA通常由20~40个PCR循环组成。
每个循环由高温变性、低温退火、适温延伸3个步骤组成。高温时, DNA变性,氢键打开,双链变为单链以作为扩增的模板;低温时,一对引物(即左端引物和右端引物) 分别与模板DNA的2条单链特异性互补结合, 即退火;
然后适温时, 在DNA聚合酶介导下, 将4种三磷酸脱氧核苷(dATP、dTTP、dGTP、dCTP) 按碱基互补配对原则不断添加到引物末端, 按5'→3'方向将引物延伸自动合成新的DNA链, 使DNA重新变成双链。将合成的DNA双链不断重复以上的变性、退火、延伸过程, 则左、右引物间这段DNA的量就可指数倍增加。
若重复进行这一反应n次, 从理论上讲原始的DNA数量可以被扩增为原来的2”倍, 因此DNA的量在短时间内特异性地获得了极度的放大。
十、pcr扩增程序怎么写?
变性,复性,延伸三步。